序列比对分类有哪些?
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9、找到一类物种中的高度保守片段可以用多序列比对
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1、为附件中exercise1.fasta中的5条序列创建多序列比对。多序列比对工具自选。比对结果保存后通过JalView,以Clustalx颜色方案标记。将编辑后的多序列比对保存为图片提交。注意调整图片宽度及文字大小。自己尽量多的尝试一下JalView的各种功能,参考help。 JalView下载:附件中可下载Windows版JalView安装包(不含JAVA,JAVA安装参见第二章第二部分第7节:PDB文件3D展示Jsmol_附件) 课程不支持大于50M的附件上传,如需下载自带JAVA安装的Jalview安装文件或其他版本安装文件,请前往Jalview官网下载:https://www.jalview.org/Web_Installers/install.htm
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比对蛋白质序列要比比对DNA序列复杂
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对幼儿来说,排序比对物体分类要简单一些()
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2、2. 用EMBL双序列比对工具(http://www.ebi.ac.uk/Tools/psa)对下列两条序列作两次全局比对(Needle算法),第一次设置GAP OPEN=10,GAP EXTEND=0.5;第二次设置GAP OPEN=1,GAP EXTEND=5。其他参数默认。给出两次序列比对结果页面屏幕截图。你觉得哪一次的序列比对的结果更佳,给出你的评判标准。 >seq_1 VKCRLNVLLWYQDAYGEVEINDGKLYDAYVSYSDCPEDRKFVNFILKPQLERRRGYKLFL DDRDLLPRAEPSADLLVNLSRCRRLIVVLSDAFLSRAWCSHSFREGLCRLLELTRRPIFI TFEGQRRDPAHPALRLLRQHRHLVTLLLWRPGSVTPSSDFWKEVQLALPRKVQYRPVEGD PQTQLQDDKDPMLILRGRVPEGRAL >seq_2 MLGQCTQTWHRVRKTTQEQLKRNVRFHAFIS
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